Afecţiunile provocate de bacteria Clostridium difficile, contractată tipic de pacienţii spitalelor şi ai clinicilor, se pot dovedi foarte greu de vindecat prin tratament convenţional cu antibiotice. De aceea, profesorul Thomas Borody se numără printre acei experţi care consideră refacerea florei intestinale o misiune potrivită pentru transplantul de materii fecale.