De ce a secvențiat Islanda fiecare caz de COVID-19 apărut în țară de la începutul pandemiei

Islanda a secvențiat genetic toate cazurile de COVID-19 apărute în țară de la începutul pandemiei, practica dovedindu-se tot mai crucială pe măsură ce noi tulpini de SARS-CoV-2 apar în Marea Britanie și Africa de Sud.

Organizația Mondială a Sănătății (OMS) a sfătuit recent toate țările să intensifice secvențierea genomurilor pentru a combate apariția noilor variante.

• Cum și-a salvat Pământul apa de la distrugere totală în urmă cu 4,6 miliarde de ani
• Sonda MAVEN se rotește neputincioasă după ce s-a pierdut contactul

Oamenii de știință de la laboratorul grupului biofarmaceutic deCODE Genetics din Reykjavik lucrează neîncetat de 10 luni, analizând fiecare caz pozitiv de coronavirus din Islanda la cererea autorităților medicale ale țării.

Scopul este monitorizarea fiecărui caz pentru a le preveni pe cele problematice care ar putea trece neobservate.

„Secvențierea în sine nu necesită foarte mult timp”, a explicat Olafur Thor Magnusson, directorul laboratorului, adăugând că „în jur de trei ore” sunt necesare pentru a determina tulpina unui virus.

463 de variante diferite, identificate prin secvențiere

Întregul proces, de la izolarea ADN-ului la secvențiere, poate dura în jur de o zi și jumătate, însă a permis Islandei să identifice 463 de variante diferite, pe care oamenii de știință le numesc haplotipuri.

Înainte de secvențiere, ADN-ul din fiecare mostră este mai întâi izolat, iar apoi purificat. Mostrele sunt apoi transportate într-o încăpere uriașă, plină cu echipamente, unde un sunet asurzitor este emanat de micile mașinării care sunt asemănătoare unor scanere. Mașinăriile permit secvențierea genetică care cartografiază genomul noului coronavirus.

Această tehnologie a jucat un rol major în Islanda de la începutul pandemiei.

„Secvențierea mostrelor este crucială și ne ajută să urmărim starea și dezvoltarea epidemiei”, a precizat Svandis Svavarsdottir, ministrul Sănătății al Islandei.

6.000 de cazuri de COVID-19 secvențiate în Islanda

Autoritățile au folosit informațiile rezultate prin secvențiere pentru a decide asupra măsurilor de combatere a răspândirii virusului. Deși varianta din Africa de Sud nu a fost detectată în Islanda, 41 de oameni au fost identificați ca fiind purtători ai variantei britanice. Toți aceștia au fost opriți la graniță, acolo unde călătorii sunt supuși testării PCR, prevenind astfel transmiterea variantei pe insula subarctică.

De asemenea, identificarea ADN-ului a făcut posibilă stabilirea unei legături clare între vizitatorii unui bar din centrul Reykjavik și majoritatea infecțiilor dintr-un nou val de infectare de la mijlocul lunii septembrie. Astfel, autoritățile au decis închiderea barurilor și a cluburilor de noapte din capitală.

Lider în secvențierea noului coronavirus

Secvențierea a mai identificat și o tulpină separată de la doi turiști francezi care au fost depistați pozitivi la COVID-19 la intrarea în Islanda, aceștia fiind acuzați, în mod eronat, de cauzarea focarului din septembrie.

Toate cele 6.000 de cazuri de COVID-19 raportate în Islanda au fost secvențiate, țara devenind astfel lider în secvențierea noului coronavirus.

În timp ce mai multe țări, precum Marea Britanie, Danemarca, Australia și Noua Zeelandă, desfășoară niveluri crescute de secvențiere, niciuna dintre acestea nu se apropiere de Islanda, deși statisticile globale sunt incomplete.

Așadar, de ce este Islanda atât de avansată?

Cartografierea genetică este specialitatea deCODE. Fondată în 1996, compania a desfășurat cel mai amplu studiu genetic asupra unei populații. Pentru un studiu din 2015 asupra factorilor de risc pentru cancer, compania a secvențiat genomurile a 2.500 de islandezi și a studiat profilul genetic a unei treimi din populația de la acea vreme, 330.000, potrivit Science Alert.

Comparativ cu acele cercetări, secvențierea mostrelor de COVID-19 este o joacă de copii.

„Este foarte ușor să secvențiem acest genom viral. Are doar 30.000 de nucleotide, este o nimica toată”, a precizat Kari Stefansson, fondatorul și directorul executiv al companiei, în vârstă de 71 de ani.

Prin comparație, genomul uman analizat de obicei în laboratoare conține 3,4 miliarde de perechi de nucleotide, sau molecule organice. Deși programul riguros de secvențiere al Islandei a fost folositor pentru monitorizarea răspândirii virusului, încă nu a dus la descoperiri științifice majore pentru deCODE.

Vă mai recomandăm să citiți și:

Descoperire impresionantă în Islanda: cea mai veche așezare vikingă și un tezaur de mare valoare

Doza de natură a săptămânii: imagini cu cei mai frumoşi cai sălbatici din Islanda. FOTO

Realizare istorică. Oamenii de știință au reușit secvențierea genetică a ciupercii folosite pentru a obține primele antibiotice

A fost secvențiat cel mai vechi ADN de Neanderthal din Europa Centrală și de Est. Ce au aflat oamenii de știință