Home » Natura » Genotipul musculiței de oțet, secvențiat în premieră de cercetători români. Procedura științifică are implicații importante

Genotipul musculiței de oțet, secvențiat în premieră de cercetători români. Procedura științifică are implicații importante

Autor: Redactia Descopera.ro 06.25.2020
Genotipul musculiței de oțet, secvențiat în premieră de cercetători români. Procedura științifică are implicații importante
Credit foto: Universitatea București

O echipă de cercetători și studenți români a secvențiat în premieră genotipul unei musculițe de oțet, un organism eucariot pluricelular.

Specialiști și studenți ai Departamentului de Genetică al Facultății de Biologie din cadrul Universității din București (UB) au realizat, integral în România, prima secvențiere a genotipului unui organism eucariot pluricelular (din aceasta categorie fac parte toate plantele si animalele). „Denumirea de genotip este mai potrivită pentru informația genetică a unui individ sau a unei populații locale decât termenul general, de genom, care ar trebui utilizat pentru specie”, afirmă autorii cercetării.

Echipa laboratorului Drosophila a secvențiat genotipul (Whole Genome Sequencing) unei linii autohtone de Drosophila melanogaster (musculița de oțet), derivată din indivizi colectați din zona sub-montană Romanii de Sus – Horezu (Vâlcea) și stabilizată în cadrul laboratorului.

„Experiența practică dobândită în cadrul acestui proiect pilot va permite echipei laboratorului Drosophila din cadrul Facultății de Biologie a UB să abordeze numeroase aspecte teoretice și practice legate de genomica și genetica speciei D. melanogaster, dar și să ia în calcul secvențierea genotipurilor și genomurilor altor linii sau specii de interes, inclusiv Homo sapiens”, afirmă sursa citată.

De altfel, una dintre principalele activități de cercetare desfășurate în laboratorul Drosophila al Facultății de Biologie a UB este analiza bioinformatică a prezenței, frecvenței și distribuției elementelor genetice mobile, numite transpozoni, în genotipul liniei Horezu.

Interpretarea datelor, o mare provocare

Autorii acestei cercetări afirmă că interpretarea datelor de secvențiere „reprezintă o mare provocare în ceea ce privește complexitatea softwarelor de bioinformatică și puterea de calcul necesare pentru adnotarea structurală a transpozonilor de interes din genotipul liniei D. melanogaster-Horezu”.

Interpretarea datelor de secvențiere referitoare la linia românească de D. melanogaster a fost realizată în laboratorul Drosophila al Facultății de Biologie a UB, inclusiv cu ajutorul programului de bioinformatică Genome ARTIST (www.genomeartist.ro), dezvoltat tot în acest laborator.

Membrii echipei implicate în experimentul de secvențiere sunt lect. univ. dr. Rațiu C. Attila, doctorand Bologa M. Alexandru, masterand Ghiță C. Iulian, student Bălănescu V. Mihnea și conf. univ. dr. Alexandru Al. Ecovoiu.

Colecția de secvențe a fost depozitată în baza de date internațională National Center for Biotechnology Information (NCBI).

Cele mai noi articole
Comisia Europeană a făcut primul pas spre reducerea la zero a poluării
Comisia Europeană a făcut primul pas spre reducerea la zero a poluării
Cercetătorii cred că știu de ce munții de pe Pluto sunt acoperiți de zăpada
Cercetătorii cred că știu de ce munții de pe Pluto sunt acoperiți de zăpada
Cum arăta prima Dacia 1100 scoasă pe linia de producţie a uzinei de la Mioveni
Cum arăta prima Dacia 1100 scoasă pe linia de producţie a uzinei de la Mioveni
Tratamente și soluții pentru COVID-19. Cele mai recente studii despre medicamentele folosite în tratarea infecției cu SARS-CoV-2
Tratamente și soluții pentru COVID-19. Cele mai recente studii despre medicamentele folosite în tratarea infecției cu ...
Vremea se schimbă dramatic. După câteva zile reci, urmează temperaturi de 25 de grade Celsius
Vremea se schimbă dramatic. După câteva zile reci, urmează temperaturi de 25 de grade Celsius
Cum au evoluat costumele de baie de-a lungul istoriei. Top 30 de imagini unice
Cum au evoluat costumele de baie de-a lungul istoriei. Top 30 de imagini unice
Atlanticul a trecut prin cea mai călduroasă decadă din ultimele trei milenii
Atlanticul a trecut prin cea mai călduroasă decadă din ultimele trei milenii
Cercetătorii au descoperit viteza maximă a sunetului
Cercetătorii au descoperit viteza maximă a sunetului
Top șapte incendii care au influențat major istoria
Top șapte incendii care au influențat major istoria
Un patogen care  a făcut ravagii secolul trecut ar putea cauza din nou probleme
Un patogen care  a făcut ravagii secolul trecut ar putea cauza din nou probleme
Premieră: Clujul construiește un parc de cercetare pentru tehnologii avansate în energii alternative
Premieră: Clujul construiește un parc de cercetare pentru tehnologii avansate în energii alternative
Teritoriul neatins de pandemie, în care nu a fost înregistrat niciun caz de COVID-19
Teritoriul neatins de pandemie, în care nu a fost înregistrat niciun caz de COVID-19
Terapia cu ajutorul câinilor, tot mai căutată în ultimul timp pentru copiii care suferă de autism
Terapia cu ajutorul câinilor, tot mai căutată în ultimul timp pentru copiii care suferă de autism
Cum a răspuns Samsung la decizia Apple de a scoate încărcătorul din cutia iPhone 12?
Cum a răspuns Samsung la decizia Apple de a scoate încărcătorul din cutia iPhone 12?
Vești bune pentru gameri, Windows 10 va avea o nouă secțiune Refresh Rate
Vești bune pentru gameri, Windows 10 va avea o nouă secțiune Refresh Rate
Un harnașament din Epoca Fierului, descoperit în Polonia de arheologi amatori
Un harnașament din Epoca Fierului, descoperit în Polonia de arheologi amatori
Fizicienii au reușit să producă, pentru prima oară, supraconductibilitate la temperatura camerei
Fizicienii au reușit să producă, pentru prima oară, supraconductibilitate la temperatura camerei
O nouă superputere a tardigradelor a fost descoperită: un scut protector fluorescent
O nouă superputere a tardigradelor a fost descoperită: un scut protector fluorescent