Un nou instrument de cartografiere a ARN-ului deschide accesul la probe vechi, de la țesuturi canceroase păstrate de un deceniu până la creierul conservat al lui Albert Einstein.
Așadar, ar putea creierul conservat al lui Albert Einstein, tăiat în 240 de fragmente și depozitat din 1955, să ofere indicii despre baza celulară a geniului? Ar putea țesuturi canceroase congelate demult, ascunse în arhivele spitalelor timp de aproape un deceniu, să dezvăluie acum secretele evoluției tumorale?
Oamenii de știință chinezi afirmă că tehnica lor îmbunătățită de cartografiere a ARN-ului ar putea, într-o zi, să facă posibil un astfel de studiu.
O echipă de la BGI-Research și institute partenere a dezvoltat Stereo-seq V2, un instrument avansat de transcriptomică spațială capabil să analizeze probe biologice vechi considerate anterior inutilizabile.
Metoda a reușit să proceseze țesuturi canceroase păstrate în condiții precare timp de aproape un deceniu, oferind speranța că mostre conservate de multă vreme ar putea fi exploatate pentru noi descoperiri științifice, scrie InterestingEngineering.
Creierul lui Einstein a fost conservat folosind metode din mijlocul secolului XX, cu mult înainte de progresele în stocarea materialului genetic, ceea ce face incertă viabilitatea sa. Totuși, descoperirea Stereo-seq V2 marchează un pas major spre valorificarea informațiilor din arhivele clinice vechi.
Specimenele biologice tradiționale sunt păstrate în blocuri de țesut fixate cu formalină și incluse în parafină (FFPE) — o metodă ieftină și stabilă pe termen lung, dar care provoacă daune chimice. Această degradare a limitat analizele ADN și ARN, cruciale deoarece ADN-ul stochează informația genetică, iar ARN-ul o transformă în proteine.
Stereo-seq V2 depășește aceste bariere prin îmbunătățirea eficienței de captare a ARN-ului și utilizarea unei chimii pentru a obține acoperirea completă a genelor, chiar și în probe degradate. În testări, instrumentul a cartografiat ARN-ul la rezoluție de o singură celulă, identificând subtipuri tumorale și răspunsuri imunitare în țesuturi canceroase vechi.
„Dacă probele sunt prea degradate, nu le putem analiza eficient”, a explicat autoarea corespondentă, Liao Sha, director tehnologic la STOmics.
Dincolo de oncologie, platforma a demonstrat deja că poate analiza simultan ARN-uri gazdă și microbiene în studiile despre tuberculoză, oferind perspective asupra modului în care agenții patogeni interacționează cu sistemele imunitare de-a lungul timpului.
Cercetătorii cred că această abordare ar putea duce la diagnosticare mai timpurie, tratamente personalizate pentru cancer și studii retrospective pe specimene arhivate.
Spitalele ar putea, de asemenea, să exploreze crearea de laboratoare comune pentru procesarea probelor la fața locului, reducând riscurile asociate transferurilor externe.
Deși perspectiva de a descifra „geniul lui Einstein” rămâne incertă, aplicațiile practice ale Stereo-seq V2 sunt imediate, oferind oamenilor de știință instrumente mai performante pentru a explora biologia cancerului, a infecțiilor și a bolilor rare ascunse în arhivele de țesuturi.
Studiul a fost publicat în revista Cell.
O veche dispută între Albert Einstein și Niels Bohr, în sfârșit rezolvată. Cine a greșit?
Test de cultură generală. Ce s-a întâmplat cu creierul lui Albert Einstein după moarte?
O predicție extraordinară a lui Albert Einstein despre găurile negre a fost confirmată