Home » Lumea digitala » Un nou algoritm poate identifica genele asociate cancerului

Un nou algoritm poate identifica genele asociate cancerului

Autor: Adrian Popovici 11.18.2020
Un nou algoritm poate identifica genele asociate cancerului
Algoritmul oferă o înțelegere mai bună a mecanismelor genetice care se află în spatele dezvoltării tumorilor. Credit foto: Unsplash

Algoritmul oferă o înțelegere mai bună a mecanismelor genetice care se află în spatele dezvoltării tumorilor.

Un nou studiu, realizat de cercetători de la Universitatea din California (UCI), SUA , a aprofundat înțelegerea mecanismelor epigenetice în apariția tumorilor și a dezvăluit un repertoriu nedetectat anterior de gene care favorizează apariția cancerului.

Folosind un nou algoritm de predicție, numit DORGE (Discovery of Oncogenes and tumor suppressoR genes using Genetic and Epigenetic features), cercetătorii au reușit să identifice noi gene supresoare tumorale (TSG) și oncogene (OG), în special cele cu mutații rare, prin integrarea celei mai cuprinzătoare colecții de date genetice și epigenetice, notează Medicalxpress.

Cel mai avansat algoritm din domeniu

„Algoritmii bioinformatici existenți nu valorifică suficient caracteristicile epigenetice pentru a identifica genele care conduc la cancer, în ciuda faptului că se știe că modificările epigenetice sunt asociate cu genele care conduc la cancer”, a declarat autorul principal dr. Wei Li, profesor de bioinformatică la Departamentul de Chimie Biologică de la Școala de Medicină UCI.

„Algoritmul nostru de calcul integreaza date publice cu privire la alternanțele epigenetice si genetice, pentru a imbunatati predictia genelor care conduc la apariția cancerului”, adaugă cercetătorul.

Cancerul rezultă dintr-o acumulare de modificări genetice cheie care perturbă echilibrul dintre diviziunea celulară și apoptoză, o formă de moarte celulară programată. Genele cu mutații care afectează progresia cancerului sunt cunoscute sub numele de gene conducătoare și pot fi clasificate drept gene TSG și oncogene OG pe baza rolurilor lor în progresia cancerului.

Acest studiu a demonstrat modul în care genele responsabile de cancer, prezise de DORGE, includeau atât gene cunoscute, cât și noi gene, care nu au fost raportate în literatura actuală. În plus, cercetătorii au descoperit că noile gene dual-funcționale, pe care DORGE le-a prezis atât ca TSG-uri, cât și OG-uri, sunt extrem de îmbogățite în interacțiunea proteină-proteină (PPI) și rețelele medicament/compus-genă.

„Algoritmul nostru DORGE, a folosit cu succes datele publice pentru a descoperi modificările genetice și epigenetice care joacă roluri semnificative în activitatea genelor care duc la cazurile de cancer”, a explicat Li. „Aceste descoperiri ar putea fi esențiale în îmbunătățirea eforturilor de prevenire, diagnostic și tratament a cancerului în viitor”, concluzionează acesta.

Citește și:

Studiu: 1 din 8 pacienți de cancer prezintă mutații genetice moștenite

Exercițiile fizice încetinesc dezvoltarea cancerului prin intermediul sistemului imunitar

Cercetătorii au descoperit, în premieră, o legătură moleculară între anumite alimente și riscul apariției cancerului

Oamenii de știință au identificat zeci de gene care permit cancerului să evite sistemul imunitar

Cele mai noi articole
Investigații după moartea lui Diego Maradona: Conversații prin WhatsApp au fost confiscate
Investigații după moartea lui Diego Maradona: Conversații prin WhatsApp au fost confiscate
Marea Britanie, prima țară din lume care a aprobat folosirea vaccinului Pfizer/BioNTech
Marea Britanie, prima țară din lume care a aprobat folosirea vaccinului Pfizer/BioNTech
Cum arăta prima Dacia 1100 scoasă pe linia de producţie a uzinei de la Mioveni
Cum arăta prima Dacia 1100 scoasă pe linia de producţie a uzinei de la Mioveni
T. Rex trecea printr-o perioadă de creștere rapidă în timpul adolescenței
T. Rex trecea printr-o perioadă de creștere rapidă în timpul adolescenței
Picturile rupestre erau ”inspirate” de substanțe halucinogene
Picturile rupestre erau ”inspirate” de substanțe halucinogene
Cum au evoluat costumele de baie de-a lungul istoriei. Top 30 de imagini unice
Cum au evoluat costumele de baie de-a lungul istoriei. Top 30 de imagini unice
O specie de viespi creează probleme zborurilor cu avionul
O specie de viespi creează probleme zborurilor cu avionul
Două vaccinuri anti-coronavirus ar putea fi disponibile în SUA înainte de Crăciun
Două vaccinuri anti-coronavirus ar putea fi disponibile în SUA înainte de Crăciun
Evitarea unor efecte nefaste ale încălzirii climatice asupra Africii ar fi posibilă prin reducerea cantității de raze solare
Evitarea unor efecte nefaste ale încălzirii climatice asupra Africii ar fi posibilă prin reducerea cantității de raze ...
Momente inedite din pădure: Un urs descoperă și analizează o cameră video de monitorizare a faunei
Momente inedite din pădure: Un urs descoperă și analizează o cameră video de monitorizare a faunei
Mai mulţi japonezi au murit din cauza sinuciderii luna trecută decât de COVID-19 în 2020
Mai mulţi japonezi au murit din cauza sinuciderii luna trecută decât de COVID-19 în 2020
China încearcă să schimbe povestea originii noului coronavirus. De unde susține că ar proveni COVID-19
China încearcă să schimbe povestea originii noului coronavirus. De unde susține că ar proveni COVID-19
Propunerea Germaniei legată de vaccinarea împotriva coronavirusului
Propunerea Germaniei legată de vaccinarea împotriva coronavirusului
5 lucruri pe care trebuie să le știi despre Skoda Octavia, modelul cu șanse mari să ajungă Mașina Anului 2021 în România
5 lucruri pe care trebuie să le știi despre Skoda Octavia, modelul cu șanse mari să ajungă Mașina Anului 2021 în România
Rămășițele unui fort vechi de 3.000 de ani, din vremea regelui David, descoperite în Israel
Rămășițele unui fort vechi de 3.000 de ani, din vremea regelui David, descoperite în Israel
Un astronom amator a identificat sursa semnalului Wow!, o stea în jurul căreia ar putea exista exoplanete locuibile
Un astronom amator a identificat sursa semnalului Wow!, o stea în jurul căreia ar putea exista exoplanete locuibile
Armata Statelor Unite ale Americii dezvoltă tehnologie prin care va putea citi gândurile soldaților
Armata Statelor Unite ale Americii dezvoltă tehnologie prin care va putea citi gândurile soldaților
Sfaturi pentru amenajarea și întreținerea unei biblioteci
Sfaturi pentru amenajarea și întreținerea unei biblioteci