Home » Lumea digitala » Un nou algoritm poate identifica genele asociate cancerului

Un nou algoritm poate identifica genele asociate cancerului

Adrian Popovici 11.18.2020
Un nou algoritm poate identifica genele asociate cancerului
Algoritmul oferă o înțelegere mai bună a mecanismelor genetice care se află în spatele dezvoltării tumorilor. Credit foto: Unsplash

Algoritmul oferă o înțelegere mai bună a mecanismelor genetice care se află în spatele dezvoltării tumorilor.

Un nou studiu, realizat de cercetători de la Universitatea din California (UCI), SUA , a aprofundat înțelegerea mecanismelor epigenetice în apariția tumorilor și a dezvăluit un repertoriu nedetectat anterior de gene care favorizează apariția cancerului.

Folosind un nou algoritm de predicție, numit DORGE (Discovery of Oncogenes and tumor suppressoR genes using Genetic and Epigenetic features), cercetătorii au reușit să identifice noi gene supresoare tumorale (TSG) și oncogene (OG), în special cele cu mutații rare, prin integrarea celei mai cuprinzătoare colecții de date genetice și epigenetice, notează Medicalxpress.

Cel mai avansat algoritm din domeniu

„Algoritmii bioinformatici existenți nu valorifică suficient caracteristicile epigenetice pentru a identifica genele care conduc la cancer, în ciuda faptului că se știe că modificările epigenetice sunt asociate cu genele care conduc la cancer”, a declarat autorul principal dr. Wei Li, profesor de bioinformatică la Departamentul de Chimie Biologică de la Școala de Medicină UCI.

„Algoritmul nostru de calcul integreaza date publice cu privire la alternanțele epigenetice si genetice, pentru a imbunatati predictia genelor care conduc la apariția cancerului”, adaugă cercetătorul.

Cancerul rezultă dintr-o acumulare de modificări genetice cheie care perturbă echilibrul dintre diviziunea celulară și apoptoză, o formă de moarte celulară programată. Genele cu mutații care afectează progresia cancerului sunt cunoscute sub numele de gene conducătoare și pot fi clasificate drept gene TSG și oncogene OG pe baza rolurilor lor în progresia cancerului.

Acest studiu a demonstrat modul în care genele responsabile de cancer, prezise de DORGE, includeau atât gene cunoscute, cât și noi gene, care nu au fost raportate în literatura actuală. În plus, cercetătorii au descoperit că noile gene dual-funcționale, pe care DORGE le-a prezis atât ca TSG-uri, cât și OG-uri, sunt extrem de îmbogățite în interacțiunea proteină-proteină (PPI) și rețelele medicament/compus-genă.

„Algoritmul nostru DORGE, a folosit cu succes datele publice pentru a descoperi modificările genetice și epigenetice care joacă roluri semnificative în activitatea genelor care duc la cazurile de cancer”, a explicat Li. „Aceste descoperiri ar putea fi esențiale în îmbunătățirea eforturilor de prevenire, diagnostic și tratament a cancerului în viitor”, concluzionează acesta.

Citește și:

Studiu: 1 din 8 pacienți de cancer prezintă mutații genetice moștenite

Exercițiile fizice încetinesc dezvoltarea cancerului prin intermediul sistemului imunitar

Cercetătorii au descoperit, în premieră, o legătură moleculară între anumite alimente și riscul apariției cancerului

Oamenii de știință au identificat zeci de gene care permit cancerului să evite sistemul imunitar

Cele mai noi articole
Petiție împotriva lui Jeff Bezos. Peste 14.000 de oameni nu vor ca fondatorul Blue Origin să se reîntoarcă pe Pământ
Petiție împotriva lui Jeff Bezos. Peste 14.000 de oameni nu vor ca fondatorul Blue Origin să se reîntoarcă pe Pământ
Palatul Brukenthal din Avrig, bijuteria în stil baroc de la poalele Munților Făgăraș
Palatul Brukenthal din Avrig, bijuteria în stil baroc de la poalele Munților Făgăraș
Misiune contracronometru. Căprioară căzută într-un canal de irigații, salvată de pompierii din Neamț
Misiune contracronometru. Căprioară căzută într-un canal de irigații, salvată de pompierii din Neamț
Un mare explorator ar fi putut avea sclavi negri. Abolirea acestui obicei s-a făcut cu mai puţin timp în urmă decât te-ai aştepta
Un mare explorator ar fi putut avea sclavi negri. Abolirea acestui obicei s-a făcut cu mai puţin timp în urmă decât ...
Câte zile libere mai au românii în 2021
Câte zile libere mai au românii în 2021
Medicul Valeriu Gheorghiță spune că varianta Delta va deveni dominantă: „Perspectiva unui nou val e clară”
Medicul Valeriu Gheorghiță spune că varianta Delta va deveni dominantă: „Perspectiva unui nou val e clară”
Un tezaur de monede din argint descoperit în Polonia ar fi făcut parte dintr-o răscumpărare uriașă plătită vikingilor
Un tezaur de monede din argint descoperit în Polonia ar fi făcut parte dintr-o răscumpărare uriașă plătită vikingilor
O „bestie bizară”, blocată în chihlimbar milioane de ani, este o reptilă cu adevărat neobișnuită
O „bestie bizară”, blocată în chihlimbar milioane de ani, este o reptilă cu adevărat neobișnuită
Un test de sânge poate dezvălui în doar 24 de ore dacă un tratament împotriva cancerului funcționează
Un test de sânge poate dezvălui în doar 24 de ore dacă un tratament împotriva cancerului funcționează
Zgura de furnal de la LIBERTY Galați, folosită la producerea de ciment cu amprentă redusă de carbon
Zgura de furnal de la LIBERTY Galați, folosită la producerea de ciment cu amprentă redusă de carbon
Ciclonii și Marea Neagră. Cât de intens va fi cel care va „lovi” în weekend
Ciclonii și Marea Neagră. Cât de intens va fi cel care va „lovi” în weekend
Vapoarele care exportă animale vii, cea mai periculoasă flotă din lume
Vapoarele care exportă animale vii, cea mai periculoasă flotă din lume
Un medicament Pfizer pentru artrita reumatoidă este benefic în infecția COVID-19
Un medicament Pfizer pentru artrita reumatoidă este benefic în infecția COVID-19
Motivul pentru care Statele Unite interzic importurile de câini din peste 100 de ţări
Motivul pentru care Statele Unite interzic importurile de câini din peste 100 de ţări
Avertismentul unui epidemiolog român: Șansa reală de a preveni un nou val de infectări se reduce spre zero
Avertismentul unui epidemiolog român: Șansa reală de a preveni un nou val de infectări se reduce spre zero
Al treilea cel mai mare diamant din lume, descoperit în Botswana. Câte carate are
Al treilea cel mai mare diamant din lume, descoperit în Botswana. Câte carate are
Liliecii din Elveția găzduiesc diverse virusuri, unele potențial zoonotice
Liliecii din Elveția găzduiesc diverse virusuri, unele potențial zoonotice
Incidentul de la centrala nucleară Taishan. Ce spune China despre nivelul radiațiilor
Incidentul de la centrala nucleară Taishan. Ce spune China despre nivelul radiațiilor